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赫哲人大体上实行土葬。早年的丧葬比较简单，人死了用白桦树皮裹严，扎上三道树皮绳，挖坑掩埋即可。后来发展到挖一长方形土坑，四周用原木垒成框壁，下面铺原木，垫草、铺褥，把尸体仰放在墓穴之中，并将死者生前最常用和最喜爱的东西放入墓中做陪葬品，上面也用原木摆盖好，铺草培土成一拱起的土堆，形成坟墓。后来受满、汉族的影响，也开始用木板棺材殓葬了。
赫哲人的丧葬仪式根据死者的死因也各有不同。狩猎死于山中者，以桦树皮或树枝裹尸架在树上，待二、三年后埋葬；死在家中者，停放三日后装棺埋葬；死于非命者隔日埋葬；死于天花或瘟疫者当日以火焚尸即火葬。小孩死后不埋葬，用桦树皮卷起捆扎好挂在树杈上，认为孩子灵魂小，埋在地下灵魂出不来，唯恐其不能投胎和怕自己不再生孩子。
赫哲人的丧葬，出殡时请萨满跳神、唱神歌，意在使亡人到了“依木尔汗”（阎王）处不至受罪。也有设“档子”、“撂档子”的风习。设“档子”是在男人死后第七天，女人死后第九天晚上迎接死者灵魂归来，放上供桌、供品，点上“僧其勒”香草，即所谓“档子”。“撂档子”是送死者的灵魂去阴间，在人死后一、二、三周年时举行。“撂档子”要举行既隆重又严肃的仪式，请萨满跳神三天。第三天晚上，将一代表死者的人偶（木古法）放在“托日乞”上送走。送死者灵魂去阴间的时候，萨满站在高处或搭的高架上，向西方射三箭，指示死者的灵魂朝第三箭射的方向走。待萨满说已将死者的灵魂送到了阴间后，死者的家人在墓上处理“档子”所用的物品并脱孝服，至此，一个亡者的丧葬方告结束。