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回回医学是中国传统医学与阿拉伯-伊斯兰医学“东西合璧”的产物。当欧洲其它各国尚未脱离神学统治之时，阿拉伯人开始发展科学文化。他们开办大学、建立图书馆，培养了大批人才，阿拉伯文化达到较高水平，在所有科目中，医学是最主要的，也取得了巨大成就。
随着阿拉伯人与邻国的交往，邻国文化随之在阿拉伯诸国渗透，并互相补益，医学上也是如此。伊斯兰教创始人穆罕默德曾说过：“学问远在中国，亦当求之”。中阿于公元651年正式友好往来，医药方面的交往也兴于此时。因此许多阿拉伯学者，特别是一些哲学家不断总结自己民族的医疗实践经验，同时还将其它国家的医学著作译成阿文。如格夫退叶在《哲学家传记》一书中提到：“巴士拉医生马西尔朱卫是哈里发奥马?阿不杜?阿齐兹时代以色列学者，其真名叫马西尔?吉斯，精通医学，在奥马尔时主持翻译爱赫兰?格斯的医学著作，成书于哈里发穆尔时代，他的另两部著作是《食物的力量及益损》和《草药的功能及益损》”。在哈里发奥马尔时代（公元717年至719年）还请精明医生充当教育和医学顾问。倭玛亚王朝的另一个哈里发哈立德?叶其德是第一个将希腊文天文学、医学、化学等专著译成阿拉伯文的人，由于其哲学、文学修养高深，贡献卓著，被阿拉伯后世学者称为贤哲。不言而喻，随文化交流，医学理论的相互补益渗透现象在后世阿拉伯医着中不乏其例，这与中国中医药著作的《海药本草》《千金要方》《本草纲目》等记载阿拉伯医药同属一理，都是历史事实。
早在公元7世纪，阿拉伯一伊斯兰医学曾居世界医学的先进行列，并对西方现代医学有巨大影响。到中世纪，阿拉伯伟大的哲学家、科学家、医学家阿维森纳的足迹遍及伊拉克、波斯、阿塞拜疆、巴基斯坦大片土地。他一生大胆实践，潜心钻研，广征博求，于公元980至1037年着成熔古希腊医学、印度医学、中国医学、阿拉伯医学与哲学于一炉的巨著——《医典》，成为现代医学和阿拉伯医学的奠基人。中世纪阿拉伯医学著作繁多，不少已散失，包括《医典》在内，流传至今尚有400多种。
由于阿拉伯医学广泛吸收希腊医学、罗马医学、印度医学（包括中国医学的脉学在内）的精髓，在漫长的历史过程中逐渐形成了自己的医学体系。其理论核心是“四大物质学说”、“四津学说”。到公元12世纪，伊朗着名医家拉齐斯的医学巨著《综合医学》10卷和阿巴萨德?达维亚的《综合百科全书》问世，更加丰富了阿拉伯医学的治疗学内容。是时阿拉伯医学已成为有理论有丰富经验的古代医学.
中国回回医学的发展，相伴于中阿医药交流。中阿医药交流历史源远流长，最早可追溯到西汉。当时张骞两次出使西域后，中国与西域之交流日益频繁，据史料记载张骞曾到达大宛（即今之中亚费尔干纳）、大月氏（即今之阿富汗北部）、大夏（即今之阿姆河南）、康居（即今之中亚撒马尔罕）等国，并从大月氏经安息（即今之伊朗）直抵大秦（即今之罗马）。张骞的副使曾达身毒国（即今之印度北、盂加拉、巴基斯坦一带）及??宾（即今之克什米尔及巴基斯坦北部），经此路输入中国的物品中有不少药物，据范行准先生统计：矿物药如石硫黄、密陀僧等凡18种，植物药如木香、豆蔻等凡58种，动物药羚羊角及龙涎等凡16种，共计92种。其中相当一部分是阿拉伯地区的药物。这些药物均被当时汉医吸收和应用。