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历史上，黎族巫医较为盛行，直到现在黎族民间依然存在。黎族的巫医实际是巫与医二者融为一体的民间行医人，他们是以宗教仪式的形式，行草药医治的内容，达到给人防病治病的目的。在黎族社会中，巫医都是一般的生产劳动者，但被人们视为是沟通阳间世界和阴间世界的全知全能的“使者”与“通话人”。
在古代，巫医是黎医草药知识的积累者。一些古文献对黎族地区当时的风土民情也作了这样的记载：病不服药，惟事寨祭，或信巫鬼、重淫祀，从古然也。这从一个侧面反映了巫医在黎族民间的盛行。宋代《太平寰宇记》记载：俚（黎）人以草药医治跌打损伤及疮疖、疮毒外科一切杂症。每有奇效，然亦以迷信出之。予尝见一患痛者，俚（黎）仁老治疾，其人到病家里以鸡公一只，小尖刀一把，酒、水、米、饭，诸项陈列于堂，求者先取尖刀，纳袋中，脱草履于地，取火刀念咒，喷患处，操刀割之，脓血尽流而病者无痛苦，脓尽后，敷上药而愈。这是古文献对黎族巫医进行治疗较为详尽的记载。
在科学技术非常落后的社会，当人们遇到伤痛疾病时，由于不能科学地认识病因，而往往认为是鬼神在作祟，是病人的灵魂被鬼摄走所致。既然是鬼在作祟，就必然请求巫医来祭灵赶鬼，杀牲畜献祭。
黎族巫医为人治病时，有一套自己的方法，先通过黎族诊断法查明病因，以便在用药时做到有的放矢。接着是采用占卜的形式，通过卦象来判断是什么鬼怪作祟而导致了疾病，需要献祭什么牲畜才能换回病人的灵魂，以决定用哪种性畜祭献。黎族巫医的占卜，一般以米卜、鸡卜为主，根据米卜、鸡骨的上下正反卦位或卦符所组成的“卦象”，以判断病的轻重、安危、触犯何种鬼灵以及需要祭品等。如发热、头痛症的米卜：取一碗米，点三枝香，长把尖刀立在米中央，随之口念咒语，如尖刀立稳，即查明为“灶炉鬼”作祟，需要杀猪祭祀。一般情况下，凡肚子痛、呕吐及泄泻症的，都会认为是“风鬼”作祟，需要杀鸡祭祀；急性风症的，是“风火山鬼”作祟，急需杀黄牛祭祀；妇女难产症，为“无头鬼”作祟，要杀羊、鸡祭祀；突然昏倒不省人事症，为“龙水鬼”作祟，要杀白鸡一只、水蛇一条祭祀，还要写卦符帖在门口和周围树木。海南各地黎族的祭鬼方法从形式上看是有些不同，但就其内容看均是大同小异。
巫医在本氏族、村里或邻近村庄发生流行病时，还担负着主持有关仪式，以预防和阻止流行病的蔓延，确保人和村子的安全。如美孚方言的黎族群众，为预防天花、霍乱、鼠疫的流行，要请巫医举行宗教仪式，集体出资买鸡、猪、羊等牲畜，到野外主要交叉路口祭祀，并每家每户都要用三角枫树叶、野菠萝叶挂在门口，以阻疫病于门外。
巫医施行治病的过程一般为：令患者坐下或静躺床上，巫医左手端一碗清水，右手掌一支香燃烧，连连三次诵念咒语，（不同的病症念不同的咒语）。咒语念完后，巫医吸碗中的水一口，喷在病人身上，或抹患者痛处，有时给病人喝一口碗中水，或以笔墨写神符，后烧神符取灰放入盛水的碗中，即给患者喝神符水，或者以墨将符画在掌心，进行跳唱念咒。巫事行完后，巫医一般都要给病人服用自己配制的药，或内服，或外敷，或捻痧，或推摩，或整骨，或嘱病人家属给患者何药何物、禁忌什么。还要在门口挂着红、绿、黄三色纸符于大门外，禁止他人进家门，禁4天才结束。
巫医常治的病症一般为烧伤、烫伤、异物卡喉、跌打肿痛、各种病症、各种惊风、难产、羊癫风、精神病等。巫医治病时的场面始终维持肃静的气氛，同时要求患者敛心神、息杂念，通过施行巫术咒语，消除患者的焦虑、悲观和忧郁情绪，以调节心理平衡，此法对患者有一定的心理治疗作用。
总之，巫医是黎族社会中有知识的人，了解和掌握一些动物药和植物药知识，他们在神灵的外衣下，不知不觉地使用药物和其他一些含有一定合理成份的治疗方法，是一种虚妄与理性的杂混、谬误与科学的交织，这是黎族巫医的特点。黎族巫医不传代，也不世袭，它有虚扬观念的一面，也有合理的一面，既施行巫术咒语，也利用当地的草药进行治疗。因此，对黎族巫医我们也不能一概否定。